Cục Thuế (Bộ Tài chính) cho biết, với các giao dịch mua hàng hóa, dịch vụ trả chậm hoặc trả góp trên 5 triệu đồng, doanh nghiệp vẫn được khấu trừ thuế giá trị gia tăng đầu vào nếu có đầy đủ chứng từ thanh toán.
Trước những băn khoăn của doanh nghiệp liên quan đến quy định về khấu trừ thuế giá trị gia tăng (VAT), Cục Thuế (Bộ Tài chính) mới đây đã có công văn trả lời Cục Thuế tỉnh Bắc Ninh và Cục Thuế tỉnh Khánh Hòa, hướng dẫn cụ thể cách xử lý các vướng mắc liên quan đến khấu trừ VAT đầu vào.
Cụ thể, căn cứ khoản 2, điều 14 Luật Thuế giá trị gia tăng số 48/2024/QH13, điều kiện khấu trừ VAT đầu vào bao gồm: (i) doanh nghiệp phải có hóa đơn VAT mua hàng hóa, dịch vụ hoặc chứng từ nộp VAT ở khâu nhập khẩu, hoặc chứng từ nộp VAT thay cho phía nước ngoài; (ii) có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt đối với hàng hóa, dịch vụ mua vào, trừ các trường hợp đặc thù do Chính phủ quy định; (iii) đối với hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu còn phải có hợp đồng ký kết với bên nước ngoài, hóa đơn bán hàng, chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt, tờ khai hải quan, phiếu đóng gói, vận đơn và chứng từ bảo hiểm hàng hóa (nếu có).
Cục Thuế (Bộ Tài chính) cho biết, với các giao dịch mua hàng hóa, dịch vụ trả chậm hoặc trả góp trên 5 triệu đồng, doanh nghiệp vẫn được khấu trừ thuế giá trị gia tăng đầu vào nếu có đầy đủ chứng từ thanh toán.
Ngoài ra, Cục Thuế cũng dẫn chiếu điều 25 và điều 26 Nghị định số 181/2025/NĐ-CP Quy định chi tiết thi hành một số điều của Luật VAT về hóa đơn, chứng từ nộp thuế và chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt để hướng dẫn cụ thể. Theo đó, với các giao dịch thanh toán trả chậm, trả góp có giá trị từ 5 triệu đồng trở lên, nếu tại thời điểm thanh toán doanh nghiệp không có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt, phần VAT đầu vào tương ứng phải kê khai, điều chỉnh giảm vào kỳ tính thuế phát sinh nghĩa vụ thanh toán theo hợp đồng hoặc phụ lục hợp đồng.
Trước đó, theo phản ánh của các doanh nghiệp, việc khấu trừ VAT đầu vào đối với các giao dịch mua hàng hóa, dịch vụ trả chậm hoặc trả góp trên 5 triệu đồng gặp nhiều khó khăn. Nguyên nhân là tại thời điểm thanh toán theo hợp đồng, doanh nghiệp chưa có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt, dẫn đến không đủ điều kiện khấu trừ VAT.
Các doanh nghiệp cho biết khi đến kỳ thanh toán theo hợp đồng, họ đã chủ động kê khai điều chỉnh giảm số VAT đầu vào đối với phần giá trị hàng hóa, dịch vụ chưa có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt trong kỳ tính thuế phát sinh nghĩa vụ thanh toán. Tuy nhiên, sau thời hạn thanh toán ghi trong hợp đồng, dù doanh nghiệp đã có chứng từ thanh toán không dùng tiền mặt, nhiều văn bản của cơ quan thuế, như công văn số 434 ngày 21/8/2025 của Thuế Vĩnh Long và công văn số 2563 ngày 19/9/2025 của Thuế Ninh Bình, đều khẳng định doanh nghiệp không được kê khai khấu trừ VAT đầu vào nếu chứng từ thanh toán phát sinh sau hạn thanh toán hợp đồng.
Nhiều doanh nghiệp cho rằng quy định này gây bất lợi, bởi nếu quá hạn thanh toán, việc loại trừ VAT là hợp lý, nhưng khi đã hoàn tất thanh toán, phần thuế này nên được khấu trừ trở lại.
Thanh Cao